Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms