Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF185Q96GF1 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms