Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD0

PDXP, Pyridoxal phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXPQ96GD0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDXPQ96GD0 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDXPQ96GD0 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PDXPQ96GD0 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDXPQ96GD0 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDXPQ96GD0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PDXPQ96GD0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDXPQ96GD0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDXPQ96GD0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PDXPQ96GD0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PDXPQ96GD0 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDXPQ96GD0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDXPQ96GD0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PDXPQ96GD0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PDXPQ96GD0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDXPQ96GD0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDXPQ96GD0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDXPQ96GD0 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PDXPQ96GD0 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDXPQ96GD0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDXPQ96GD0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PDXPQ96GD0 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDXPQ96GD0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDXPQ96GD0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms