Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HDAC11Q96DB2 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms