Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF183Q96D59 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms