Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTT0

CLEC4C, C-type lectin domain family 4 member C, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4CQ8WTT0 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLEC4CQ8WTT0 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC4CQ8WTT0 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms