Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATL2Q8NHH9 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATL2Q8NHH9 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms