Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CLDN19Q8N6F1 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CLDN19Q8N6F1 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CLDN19Q8N6F1 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CLDN19Q8N6F1 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CLDN19Q8N6F1 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CLDN19Q8N6F1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CLDN19Q8N6F1 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CLDN19Q8N6F1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms