Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms