Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPAP2Q8IXW5 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms