Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms