Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms