Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM72Q6ZMU5 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms