Protein–RNA interactions for Protein: Q6J4K2

SLC8B1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8B1Q6J4K2 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC8B1Q6J4K2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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