Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATL3Q6DD88 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.3 ms