Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMPD1Q5SYB0 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms