Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 TTC8-205ENST00000358622 2297 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 LINC02172-201ENST00000507365 2264 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 LINC02170-202ENST00000562231 2218 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AC005785.2-201ENST00000624655 631 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 METTL13-201ENST00000361735 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 LIG1-201ENST00000263274 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AC004494.1-201ENST00000613210 2775 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 CWC25-202ENST00000614790 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 GRHL3-203ENST00000356046 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
ANKRD39Q53RE8 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ATP13A2-201ENST00000326735 3840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms