Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PDLIM3Q53GG5 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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