Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DUSP6Q16828 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms