Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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SGCAQ16586 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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SGCAQ16586 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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SGCAQ16586 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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SGCAQ16586 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SGCAQ16586 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
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