Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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NCOA1Q15788 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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NCOA1Q15788 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
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NCOA1Q15788 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
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NCOA1Q15788 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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NCOA1Q15788 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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NCOA1Q15788 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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NCOA1Q15788 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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NCOA1Q15788 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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NCOA1Q15788 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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NCOA1Q15788 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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NCOA1Q15788 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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NCOA1Q15788 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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NCOA1Q15788 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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NCOA1Q15788 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NCOA1Q15788 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
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