Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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RAB35Q15286 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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RAB35Q15286 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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RAB35Q15286 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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RAB35Q15286 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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RAB35Q15286 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RAB35Q15286 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RAB35Q15286 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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RAB35Q15286 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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