Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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PDCD1Q15116 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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PDCD1Q15116 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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PDCD1Q15116 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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PDCD1Q15116 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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PDCD1Q15116 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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