Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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SEMA3AQ14563 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA3AQ14563 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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