Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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COL4A6Q14031 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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COL4A6Q14031 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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COL4A6Q14031 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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COL4A6Q14031 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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COL4A6Q14031 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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COL4A6Q14031 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL4A6Q14031 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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