Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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