Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH18Q13634 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
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