Protein–RNA interactions for Protein: Q13569

TDG, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDGQ13569 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDGQ13569 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDGQ13569 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TDGQ13569 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDGQ13569 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDGQ13569 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDGQ13569 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDGQ13569 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDGQ13569 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDGQ13569 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDGQ13569 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDGQ13569 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDGQ13569 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDGQ13569 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDGQ13569 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDGQ13569 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TDGQ13569 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms