Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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