Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 GRAMD1B-202ENST00000450171 2431 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 PGGT1BP1-201ENST00000455321 1023 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AL352977.1-201ENST00000553464 453 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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MKRN4PQ13434 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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MKRN4PQ13434 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC006460.1-201ENST00000421437 808 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AC090371.1-201ENST00000580071 558 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AP000842.4-201ENST00000638781 748 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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