Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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ITGB3BPQ13352 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
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