Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CLN3Q13286 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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