Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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PTP4A2Q12974 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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PTP4A2Q12974 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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PTP4A2Q12974 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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PTP4A2Q12974 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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PTP4A2Q12974 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PTP4A2Q12974 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PTP4A2Q12974 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PTP4A2Q12974 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PTP4A2Q12974 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PTP4A2Q12974 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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