Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBRQ0VD83 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms