Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABPAQ06546 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABPAQ06546 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms