Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms