Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POU5F1Q01860 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms