Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CAP1Q01518 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CAP1Q01518 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms