Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCN7AQ01118 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms