Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX1P78414 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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