Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms