Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ABCE1P61221 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ABCE1P61221 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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