Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2NP61088 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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