Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKAA2P54646 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKAA2P54646 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms