Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTBP49356 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTBP49356 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTBP49356 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTBP49356 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTBP49356 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTBP49356 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTBP49356 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTBP49356 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTBP49356 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTBP49356 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FNTBP49356 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms