Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FDFT1P37268 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms