Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBRP36941 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBRP36941 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LTBRP36941 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTBRP36941 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTBRP36941 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTBRP36941 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTBRP36941 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTBRP36941 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTBRP36941 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTBRP36941 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTBRP36941 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTBRP36941 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LTBRP36941 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTBRP36941 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTBRP36941 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTBRP36941 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTBRP36941 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LTBRP36941 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LTBRP36941 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LTBRP36941 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms