Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

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Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GPC1P35052 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GPC1P35052 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GPC1P35052 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GPC1P35052 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GPC1P35052 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GPC1P35052 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GPC1P35052 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GPC1P35052 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GPC1P35052 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GPC1P35052 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GPC1P35052 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GPC1P35052 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GPC1P35052 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GPC1P35052 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GPC1P35052 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GPC1P35052 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GPC1P35052 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GPC1P35052 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GPC1P35052 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GPC1P35052 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GPC1P35052 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GPC1P35052 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GPC1P35052 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GPC1P35052 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GPC1P35052 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GPC1P35052 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GPC1P35052 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GPC1P35052 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GPC1P35052 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GPC1P35052 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GPC1P35052 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GPC1P35052 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GPC1P35052 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GPC1P35052 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GPC1P35052 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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GPC1P35052 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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GPC1P35052 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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GPC1P35052 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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GPC1P35052 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GPC1P35052 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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GPC1P35052 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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GPC1P35052 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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GPC1P35052 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GPC1P35052 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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