Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms