Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRMP28827 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms